まず、パールをインストールして、パスを通しておいてください。
下のテキストボックスを全選択、コピーして、メモ帳などで、ファイル名を kyu_to_shin.pl などとして保存します。文字コードは utf-8 です。
変換元となるテキストファイルが shift-jis の場合は、文字コード変数 $mojicode を書き換えてください。

plファイルを置いたフォルダの下にworksというフォルダを作って、そこに変換元となるファイルを置いてください。

［例］ 　C:\data\text\perl に kyu_to_shin.pl を置いて、
　　　　その下層のフォルダ　C:\data\text\perl\works に aozora.txt を置く。

エクスプローラから kyu_to_shin.pl を選んでエンターキーを押すと、works フォルダに kanji_shin_aozora.txt という変換済みのファイルが生成されます。